本实验在（28±1）℃下从对虾养殖池塘中分离筛选具有氨氮（包括游离氨NH3、铵盐NH4+）降解效果的芽孢杆菌（Bacillus），并采用单因素实验对筛选出的芽孢杆菌进行发酵配方优化，以此挑选出低廉高产的发酵培养基配方。菌株分离筛选及氨氮降解实验结果显示：经初步分离，得到5株芽孢杆菌（DS1、DS2、DS3、DS4、DS5），再通过氨氮降解实验得到一株能够显著降解水体氨氮的芽孢杆菌DS5，5 d内菌株DS5对水体氨氮降解迅速，在第4 天达到最大降解率（36.41±0.07）%，且最后3 d水体氨氮持续稳定在36%左右；通过菌株16S rDNA序列分析及生理生化鉴定，将菌株DS5（GenBank登录号：MK629979）初步鉴定为枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）。菌株DS5发酵配方实验结果表明：在28℃下，当碳源为5‰葡萄糖、氮源为10‰豆粕、无机盐为5‰氯化钠时，菌株生长良好，培养基含菌数较高，综合考虑成本、菌含量等因素，选择5‰葡萄糖-10‰豆粕-5‰氯化钠作为该菌的最优发酵培养基配方。

运用微卫星标记技术，选用8对微卫星引物对厦门市5个凡纳滨对虾亲虾群体（ZA1、HN、ZA2、ZP、DS）进行遗传多样性分析。结果显示，8对微卫星引物在5个凡纳滨对虾亲虾群体中共检测到75个等位基因，各群体的平均等位基因数（Na）为3.875～7.000、平均有效等位基因数（Ne）为2.632～3.719、平均PIC值范围在0.498～0.624。平均观测杂合度（Ho）为0.410～0.562、平均期望杂合度（He）为0.589～0.687。各群体的平均近交系数（Fis）为0.147～0.305，说明各群体内近交程度较高，存在杂合子缺失现象。除ZP与DS群体外，其他群体在多个微卫星位点上均显著偏离平衡（P＜0.05），说明大部分群体存在杂合子缺失现象。遗传变异分析结果显示，各群体间的遗传分化指数（Fst）为0.028～0.199；根据Fst计算得到各群体间的Slatkin’s遗传距离在0.029～0.249之间。本研究结果表明，采自厦门市的5个凡纳滨对虾亲虾群体均存在不同程度的近交现象。本文通过对厦门市5个凡纳滨对虾亲虾群体进行遗传多样性分析，旨在明确厦门市凡纳滨对虾亲虾群体的遗传结构、种质资源状况及近交程度，为该地区凡纳滨对虾种质资源的提纯、保优、复壮及遗传选育提供背景资料和建议。

为构建安全高效表达海洋源金属硫蛋白的益生菌重组菌株，以海洋源褶牡蛎内脏团为模板，PCR克隆得到褶牡蛎金属硫蛋白基因（Op-MT），大小为324 bp，经pMD19-T 载体亚克隆到融合表达载体pHT43-SUMO 中，然后通过电转化法将重组质粒转入八种蛋白酶缺陷的宿主枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) WB800N中。SDS–PAGE电泳显示诱导表达的融合蛋白SUMO-Op-MT分子量约为23 kD，与预期一致，说明可溶性融合蛋白SUMO-Op-MT在宿主菌中得到了表达，且通过Western blotting进一步得到验证。同时，HPLC检测重组枯草芽孢杆菌发酵液，结果也表明重组枯草芽孢杆菌成功表达了可溶性目的蛋白Op-MT。通过对重组工程菌中MT活性检测发现，其对重金属镉耐受力增强，说明重组工程菌成功表达出有活性的金属硫蛋白。这为以后开发天然、高效海洋源重金属解毒剂提供理论基础。

本文概括了鱼类的选择育种、驯化及杂交育种等传统鱼类育种方法，同时叙述了现代生物技术在鱼类育种中的应用，主要有多倍体育种、雌、雄核发育、核移植、转基因育种、分子标记辅助育种、基因组育种；并提出了当今鱼类育种出现的问题。同时，做出了鱼类必将走向基因组育种之路的展望，为鱼类育种的发展提供参考。